馬英九召開記者會強調，自他上任以來，絕對尊重司法，并極力維護司法獨立，不干預任何個案。對于在野黨宣稱，這是選舉操作、政治追殺及挾怨報復，馬英九語氣鏗鏘回應表示：“鄭重聲明‘絕無此事’。”也絕不容許此事在臺灣島內發(fā)生。馬英九并強調，時間會證明他對司法獨立的尊重，“我一路走來始終如一”。對于在野黨的批評，馬英九表示，“我感到非常遺憾”。

“中廣新聞網(wǎng)”報道，李登輝遭起訴，正在臺北監(jiān)獄服刑的陳水扁1日通過女兒陳幸妤轉述稱，此事跟他無關。陳幸妤說，外界誤傳李登輝會被起訴和陳水扁舉發(fā)有關，陳水扁特別提出澄清和自己無關。

陳水扁稱，當時他向前“調查局長”葉盛茂提到“新瑞都案外案”的文件，和李登輝遭起訴的“國安密帳案”無關。

對于陳水扁的說法，“中天新聞”報道說，事實上，“國安密帳案”在李扁之間是政治角力的秘密，陳水扁2002年前往探望住院的李登輝，就曾拿紙條探詢李登輝，是否涉及“國安密帳”洗錢，讓李登輝很感冒。

國民黨發(fā)言人賴素如1日也澄清表示，此案最初是特偵組調查陳水扁洗錢案時，由陳水扁主動向特偵組告發(fā)，民進黨卻刻意模糊焦點、扭曲事實，指鹿為馬，誤導視聽莫此為甚。