馬英九上任之后，開(kāi)始積極推動(dòng)新一輪“行政院”組織改造。經(jīng)過(guò)漫長(zhǎng)的朝野協(xié)商與“立法”過(guò)程，2010年1月12日，臺(tái)“立法院”終于三讀通過(guò)“行政院組織法”修正案、“中央行政機(jī)關(guān)組織基準(zhǔn)法”修正案等有關(guān)行政機(jī)關(guān)組織改造的 “政府組織再造四法”。馬英九意氣風(fēng)發(fā)地表示，這是60年來(lái)變動(dòng)最大的一次（組織改造），盼能達(dá)到“精實(shí)、彈性、效能”，并以此掌握政治風(fēng)氣，贏得民心。至此，延宕了22年的行政組織再造終于進(jìn)入了實(shí)際執(zhí)行階段。

亂象橫生 部門(mén)利益與改革目標(biāo)“拉鋸”

按照“行政組織再造四法”規(guī)劃，臺(tái)“行政院”將由目前的37個(gè)“部會(huì)”分階段整并為 “14部、8會(huì)、3獨(dú)立機(jī)關(guān)、2總處、2附屬機(jī)構(gòu)”，總計(jì)29個(gè)機(jī)關(guān)，馬“政府”編制上限也將由目前的190200人刪減至173000人。但執(zhí)行起來(lái)卻問(wèn)題不斷。例如“林務(wù)局”、“水保局”并入新成立的“環(huán)境資源部”就頗有爭(zhēng)議。有“立委”就質(zhì)疑：“未來(lái)‘環(huán)境部長(zhǎng)’究竟要找學(xué)林業(yè)、環(huán)保還是水利的？”

另外，機(jī)構(gòu)整并勢(shì)必牽涉行政資源的重新分配，強(qiáng)勢(shì)“部會(huì)”挑肥揀瘦也成了意想不到的問(wèn)題。據(jù)臺(tái)灣媒體報(bào)道，原本屬于“交通部”的“中央氣象局”，原定被改編到“環(huán)境資源部”，但又有“立委”提案要求并入“科技部”，一時(shí)間，“氣象局”何去何從難有定論，被媒體形容為“孤兒”。

當(dāng)然，目前為止最大的紛爭(zhēng)，還要數(shù)“雇員轉(zhuǎn)公務(wù)員”問(wèn)題。沒(méi)有編制的臨時(shí)雇員本是歷史遺留問(wèn)題，如今面臨組織改造，“行政院”順勢(shì)同意通過(guò)金融雇員生等考試的雇員轉(zhuǎn)任公務(wù)員。不料“考試院”反彈強(qiáng)烈，認(rèn)為是 “黑官漂白”。輿論也認(rèn)為組織改造目標(biāo)是精簡(jiǎn)人事，但“行政院”此舉不僅有礙公平，也有渾水摸魚(yú)之嫌，且違背改革目標(biāo)。對(duì)此，馬英九至今態(tài)度不明，只說(shuō)“我們會(huì)非常關(guān)心”。