中國(guó)科技網(wǎng)訊 據(jù)物理學(xué)家組織網(wǎng)12月12日（北京時(shí)間）報(bào)道，英國(guó)研究人員簡(jiǎn)化了基因組測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)流程，首次無需進(jìn)行文庫(kù)制備便完成了DNA（脫氧核糖核酸）單分子測(cè)序，而且新方法只要很少量的DNA就能獲得序列數(shù)據(jù)，用量可低至不到1納克（10億分之一克），僅為常規(guī)測(cè)序方法的500分之一到600分之一。
文庫(kù)制備是指從測(cè)序前基因組樣本中提取不同長(zhǎng)度的DNA片段，這一過程不僅費(fèi)力、費(fèi)時(shí)，還會(huì)浪費(fèi)DNA，而新技術(shù)能極大地減少DNA的損耗，并縮短測(cè)序時(shí)間。
該研究論文的第一作者、英國(guó)威康信托基金會(huì)桑格研究所的保羅·庫(kù)普蘭說：“我們用這種方法對(duì)病毒和細(xì)菌的基因組測(cè)序后發(fā)現(xiàn)，即使在相對(duì)較低的水平，我們也能夠確定所檢測(cè)的是何種有機(jī)物，不論樣本中是否存在特定的基因或質(zhì)粒（這對(duì)于確定抗生素耐藥性很重要），或者其他信息，如對(duì)特定DNA堿基的修改等?！彼硎?，一旦技術(shù)得到優(yōu)化，將在快速、高效地識(shí)別醫(yī)院和其他醫(yī)療場(chǎng)所中的細(xì)菌和病毒方面具有很大的應(yīng)用潛力。
研究小組利用第三代單分子測(cè)序系統(tǒng)PacBio RS演示了這種簡(jiǎn)化的直接測(cè)序方法。他們僅僅用800皮克（千分之一納克）DNA來分析一個(gè)生物體的基因組，盡管測(cè)序儀只讀取了基因組的70個(gè)序列片段，相對(duì)于常規(guī)測(cè)序方法獲得的數(shù)據(jù)來說不過是很小的一部分，但這些信息足以讓研究人員確定他們所檢測(cè)的生物體的品種。
這項(xiàng)技術(shù)也使得科學(xué)家能夠?qū)Υ饲盁o法識(shí)別的宏基因組（也稱微生物環(huán)境基因組）樣本中的生物體進(jìn)行確認(rèn)。“為微生物測(cè)序，首先需要能夠在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)它們?！闭撐牡闹饕髡?、英國(guó)巴布拉漢研究所的塔米爾·錢德拉說，“這不僅耗費(fèi)時(shí)間，而且有時(shí)候微生物不生長(zhǎng)，為它們的基因組測(cè)序極其困難?！彼硎?，新方法可以直接對(duì)微生物測(cè)序，短時(shí)間內(nèi)便可確定其“身份”。
論文的另一主要作者、威康信托基金會(huì)桑格研究所的哈羅德·斯維爾德洛說：“我們的技術(shù)可以在對(duì)所測(cè)序列沒有任何先驗(yàn)知識(shí)、沒有特定微生物試劑的條件下，在很短的時(shí)間內(nèi)操作，這是一種很有前途的替代手段，可應(yīng)用于控制感染等臨床需要?！保ㄓ浾哧惖ぃ?/p>
