人類開始進行基因組學研究,短短二十幾年間已完成了許多物種的基因組圖譜繪制。僅就水果而言,繼2007年葡萄、2008年番木瓜、2010年蘋果和2011年草莓的基因組公開發(fā)表,2012年5月梨的基因組精細圖譜也由南京農(nóng)業(yè)大學梨工程技術(shù)研究中心張紹鈴教授學術(shù)團隊牽頭領(lǐng)銜完成。其研究成果“The genome of pear(梨的基因組) (Pyrus bretschneideri Rehd.)”于今年2月在國際基因組研究的權(quán)威刊物《Genome Research》(《基因組研究》)上正式發(fā)表。
這是全球首個梨基因組及其基因遺傳密碼的成功解密,該研究不僅為進一步解析梨的包括產(chǎn)量、品種等在內(nèi)的重要農(nóng)藝性狀提供良好的基因數(shù)據(jù)平臺,同時也將為指導和培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)和抗病的梨新品種奠定堅實的遺傳學基礎(chǔ)。
沒有基因組,科研好比盲人摸“梨”
梨是薔薇科的重要果樹樹種,據(jù)記載有3000年以上的栽培歷史。長期以來,由于對梨的遺傳信息知之甚少,科學家們對梨的研究和品種選育,就像是“盲人摸象”。
梨基因組計劃的第一執(zhí)行人吳俊教授說:“在未知基因組的情況下研究就像是瞎子摸象,靠直覺、靠運氣,不能做到高瞻遠矚地去設(shè)計科研和開展育種。在梨基因組精細圖譜測序成功之前的科研是:當其他植物上發(fā)現(xiàn)了一個基因,我們就看看梨上有沒有類似基因,再看看有什么功能,所以以往的研究多是跟著別人走,沒有太大的創(chuàng)新,而現(xiàn)在則摸清楚了家底?!?/p>
可是摸清一個梨品種的家底又有什么意義呢?其實,物種的基因組成上有很大的相似性。有些物種,看似不同的性狀,但控制這一性狀的基因在不同個體中是一樣存在的,只是控制這些基因的開關(guān)有開有合。有些看似完全不同的兩個物種,例如同屬薔薇科的蘋果和梨,同源基因的相似度可達到80%以上或者更高。
因此,完成的梨基因組遺傳信息不僅為其他梨品種的生物學研究積累了良好的數(shù)據(jù)基礎(chǔ),同時也為開展薔薇科果樹的比較基因組學、系統(tǒng)進化以及基礎(chǔ)生物學研究提供了寶貴的信息資源。結(jié)合新興的生物信息學研究手段,以及薔薇科其他物種的基因組遺傳信息不斷擴大,將為科學家們探究薔薇科物種的染色體進化和物種形成、基因家族及功能進化等問題提供重要的數(shù)據(jù)平臺;同時,在梨上開展的生物學研究結(jié)論也將為其他未開展基因組學研究的物種,提供良好的借鑒和啟發(fā)。
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