兩岸企業(yè)家峰會2008年發(fā)端于江蘇省南京市，在國務(wù)院臺辦、有關(guān)中央部委的關(guān)心指導(dǎo)和江蘇省委省政府、南京市委市政府的大力支持下，圍繞深化兩岸經(jīng)貿(mào)合作和推動企業(yè)轉(zhuǎn)型升級主題，分別于2008年、2010年和2011年成功舉辦三屆兩岸企業(yè)家紫金山峰會，受到了兩岸各界的廣泛關(guān)注。

隨著兩岸關(guān)系和平發(fā)展不斷鞏固深化，兩岸經(jīng)貿(mào)關(guān)系已經(jīng)進入了一個新階段，兩岸產(chǎn)業(yè)的交流與合作也需要新思維、新做法。有鑒于此，兩岸經(jīng)濟界迫切需要成立一個最具權(quán)威性、開放性、務(wù)實性的高端交流合作平臺。自2012年起，峰會與兩岸經(jīng)貿(mào)文化論壇、兩會商談、海峽論壇并列為兩岸四大交流合作平臺，成為以兩岸企業(yè)家為主體，以匯聚企業(yè)家智慧、加強對話交流、深化產(chǎn)業(yè)合作為特色的兩岸企業(yè)界最有影響的交流平臺。在2012年峰會上，時任中共中央政治局常委、全國政協(xié)主席賈慶林宣布開幕，中國國民黨榮譽主席連戰(zhàn)出席并致辭。與會政經(jīng)產(chǎn)學(xué)界人士發(fā)布共同倡議，建議成立兩岸企業(yè)家峰會社團，除每年輪流在大陸及臺灣舉行年會之外，根據(jù)兩岸企業(yè)界的實際需求設(shè)立七個產(chǎn)業(yè)合作推進小組，開展常態(tài)化的交流，以具體務(wù)實的方式推動兩岸企業(yè)的合作，進一步鞏固和深化峰會年會成果。

2013年，習(xí)近平總書記兩次會見蕭萬長先生，強調(diào)要加強兩岸經(jīng)濟合作制度化建設(shè)，并更加重視促進產(chǎn)業(yè)合作，積極評價兩岸企業(yè)家峰會為兩岸企業(yè)和經(jīng)濟界人士搭建了交流對話的高端平臺，希望雙方共同努力把峰會辦好，并預(yù)祝峰會取得圓滿成功。在兩岸雙方的共同努力下，峰會組織化、機制化、長效化建設(shè)和峰會年會籌備工作取得扎實進展。2013年7月，兩岸企業(yè)家峰會社團分別在北京、臺北成立，300多位兩岸知名企業(yè)家和工商團體負(fù)責(zé)人加入峰會成為會員，選舉產(chǎn)生峰會領(lǐng)導(dǎo)機構(gòu)。中共中央政治局原委員、國務(wù)院原副總理曾培炎和臺灣地區(qū)前副領(lǐng)導(dǎo)人蕭萬長分別當(dāng)選雙方峰會理事長，十屆全國人大常委會副委員長兼秘書長盛華仁、臺灣?；鶗麻L江丙坤分別擔(dān)任雙方峰會副理事長，并邀請一批兩岸政經(jīng)產(chǎn)學(xué)界知名人士擔(dān)任峰會顧問和特聘專家。兩岸峰會理事會分別下設(shè)宏觀經(jīng)濟、能源石化裝備、金融、信息家電、成長型和中小企業(yè)、文化創(chuàng)意、生物科技與健康照護等七個產(chǎn)業(yè)合作推進小組，由兩岸相關(guān)主管部門前負(fù)責(zé)人和知名企業(yè)家擔(dān)任召集人，開展經(jīng)常性的交流互訪和產(chǎn)業(yè)對接活動。峰會大陸方面秘書處在北京市辦公，峰會臺灣方面秘書處在臺北市辦公。南京市為峰會年會大陸永久舉辦地。國務(wù)院臺灣事務(wù)辦公室為峰會社團主管部門。

兩岸企業(yè)家峰會社團自成立以來，秉持“推動兩岸企業(yè)家之間的交流，推進兩岸產(chǎn)業(yè)合作，深化兩岸經(jīng)濟互利合作，維護兩岸關(guān)系和平發(fā)展，振興中華民族經(jīng)濟”的宗旨，分別于2013年、2014年和2015年成功舉辦了三次峰會年會。